Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniea izolatlarında AmpC beta laktamaz sıklığının belirlenmesi ve tespit yöntemlerinin karşılaştırılması / Identifying the frequency of AmpC beta-lactamase Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates and comparison of detection methods

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorBalıkçı, Ahmet
dc.date.accessioned2024-07-12T21:08:42Z
dc.date.available2024-07-12T21:08:42Z
dc.date.issued2019en_US
dc.departmentFakülteler, Tıp Fakültesien_US
dc.description.abstractBu çalışmanın amacı altın standart olarak PZR yöntemini kullanarak klinik izolatlardan üreyen E.coli ve K. pneumoniae suşlarında plazmid ile kodlanmış AmpC beta-laktamazın araştırılması ve plazmid aracılı AmpC beta-laktamazların saptanması için sefoksitin-Hodge testinin ve kloksasilin inhibisyon testinin etkinliğinin karşılaştırılmasıdır. İki yıl boyunca 3,450 hastanın klinik izolatlarından sefoksitine dirençli 22 E.coli ve 18 K. pneumoniae suşu toplanmıştır. Disk difuzyon testinde sefoksitin dirençli olan suşlara AmpC geni varlığının araştırılması amacı ile MOX,CIT, EBC, FOX, DHA, EBC primerleri kullanılarak multipleks PZR uygulanmıştır. AmpC geni tesbit edilen suşlar Sefoksitin-Hodge testi ve kloksasilin inhibisyon testi ile fenotipik olarak incelenmiştir. 40 izolattan dokuzu, GSBL üretimini teyit eden klavulanik asit tarafından, altısı ise kloksasilin tarafından inhibe edildi, dokuzu sefoksitin-Hodge testi ile pozitif saptandı. Dört izolat, kombinasyon halinde GSBL ve AmpC beta-laktamaz eksprese etti. AmpC betalaktamaz genleri PZR ile incelenmiş, 40 sefoksitine dirençli izolattan 11 tanesinin plasmid aracılı AmpC beta laktamaz sentezlediği görülmüştür (Beş E.coli ve altı K. pneumoniae). 11 izolattan iki CIT, iki EBC, altı FOX, bir izolatta hem FOX ve EBC tipi gen saptanmıştır. İki fenotipik tarama yöntemi kappa analizi ile karşılaştırılmış, Hodge testi plazmid aracılı AmpC laktamazların saptanmasında rehberlerin aksine kloksasilin inhibisyon testinden daha hassas olduğu görülmüştür. Rutin laboratuvarlarda uygulanabilecek daha kolay, ekonomik ve güvenilir bir fenotipik yönteme ihtiyaç olduğu tesbit edilmiştir. en_US
dc.description.abstractThe aim of this study was to look for plasmid encoded AmpC beta-lactamase producing clinical isolates of E.coli and K. pneumoniae using the PCR method as a gold standard and also compare the efficiency of cefoxitin-Hodge test and cloxillin inhibition test for detecting plasmid-mediated AmpC beta-lactamases. Cefoxitin resistant 22 E.coli and 18 K.pneumonia, were collected from 3,450 patient in two years period. Strains which resistant in cefoxitin disk diffusion test investigate for presence of AmpC genes by multiplex PCR using primers MOX CIT, EBC, FOX, DHA, EBC primers. Strains which were positive for AmpC genes investigated by cefoxitin Hodge and cloxacillin disc tests. Among 40 isolates nine were inhibited by clavulanic acid confirming their ESBL production, nine were positive by cefoxitin-Hodge test, six isolates were inhibited by cloxacillin. Four isolates expressed ESBLs and AmpC. Genes encoding for six phylogenic groups acquired AmpC genes were examined by PZR. 11 out of 40 cefoxitin-resistant isolates included AmpC (Five E.coli ve six K. pneumoniae 9). Out of 11 isolates, two produced CIT-type enzymes, two EBC, six FOX and one both FOX and EBC type enzymes. PCR method was most sensitive technique to detect plasmidmediated AmpC lactamases. The two phenotypic screening methods were compared with kappa analysis and the Hodge test was more sensitive than the inhibition test of cloxacillin in the determination of plasmid-mediated AMPC lactamases, unlike the guidelines. It has been determined that there is a need for an easier, economical and reliable phenotypic method that can be applied in routine laboratories.en_US
dc.identifier.citationBalıkçı, A. (2019). Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniea izolatlarında AmpC beta laktamaz sıklığının belirlenmesi ve tespit yöntemlerinin karşılaştırılması / Identifying the frequency of AmpC beta-lactamase Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates and comparison of detection methods. Maltepe Tıp Dergisi. 11(1), s. 23-27.en_US
dc.identifier.endpage27en_US
dc.identifier.issn2602-2915
dc.identifier.issue2en_US
dc.identifier.startpage23en_US
dc.identifier.urihttps://dergipark.org.tr/tr/pub/maltepetipderg/issue/49544/643151
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12415/4132
dc.identifier.volume11en_US
dc.institutionauthorBalıkçı, Ahmet
dc.language.isotren_US
dc.publisherMaltepe Üniversitesien_US
dc.relation.ispartofMaltepe Tıp Dergisien_US
dc.relation.isversionof10.35514/mtd.2019.6en_US
dc.relation.publicationcategoryUlusal Editör Denetimli Degide Makaleen_US
dc.rightsCC0 1.0 Universal*
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/*
dc.snmzKY02457
dc.subjectkloksasilin AmpCen_US
dc.subjectEscherichia colien_US
dc.subjectKlebsiella pneumoniaeen_US
dc.subjectPlasmiden_US
dc.subjectAmpCen_US
dc.subjectEscherichia colien_US
dc.subjectKlebsiella pneumoniaeen_US
dc.subjectPlasmidsen_US
dc.titleEscherichia coli ve Klebsiella pneumoniea izolatlarında AmpC beta laktamaz sıklığının belirlenmesi ve tespit yöntemlerinin karşılaştırılması / Identifying the frequency of AmpC beta-lactamase Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates and comparison of detection methodsen_US
dc.title.alternativeIdentifying the frequency of AmpC beta-lactamase Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates and comparison of detection methodsen_US
dc.typeArticle
dspace.entity.typePublication

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Escherichia coli ve klebsiella pneumoniea izolatlarında...pdf
Boyut:
246.05 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Tıp Fakültesi Koleksiyonu