Yazar "Kaluç, Nur" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim Yok
    Yayın
    Mitoz sırasında H2O2 ile indüklenen oksidatif strese karşı dirençte Yca1’in rolünün incelenmesi
    (2019) Kaluç, Nur; Atalay, Pınar Buket
    Amaç: Günümüzde başarıyla kullanılan antikanser ilaçlar antitümör etkilerini mikrotübüllerinyapısını bozup hücrelerde uzun süreli mitotik arreste yol açarak gösterirler. Uzun süreli mitotikarrestin sonuçlarından biri apoptozdur. Metakaspazlar, metazoan haricindeki canlılarda bulunanve apoptozda önemli rol oynadıkları bilinen yapısal olarak kaspaz homologlarıdır. Bu çalışmada,Saccharomyces cerevisiae’de mikrotübülleri hedef alan antikanser ilaçlarla indüklenen mitotikarrestin oksidatif stres direncine etkisinin ve mayadaki tek metakaspaz olan Yca1’in bu etkidekiolası rolünün araştırılması amaçlanmıştır. Yöntem: Bu amaç için, yabanıl tip (YT) ve Yca1delesyon mutant (yca1?) suşlarında mitotik arrest nocodazole veya carbendazim ile; G1-arrestise alfa faktör ile tetiklenmiştir. Her iki suştaki protein agregat oluşumu ise cycloheximidemuamelesi ile engellenmiştir. Bu koşullardan her biri altında 6 mM H2O2 ile indüklenen oksidatifstresin YT ve yca1? suşlardaki sağkalım üzerine etkisi koloni oluşturan birim (cfu) ve nokta ekimyöntemleriyle; reaktif oksijen türleri (ROT) birikimi üzerine etkisi ise H2DCFDA yöntemiyleincelenerek karşılaştırılmıştır. Bulgular: Nocodazole veya carbendazim ile tetiklenen mitotikarrest YT S.cerevisiae hücrelerinde oksidatif stres direnci oluştururken, aynı koşullardaki yca1?suşunda ise direnç oluşturmadığı tespit edilmiştir. Diğer yandan, alfa faktörle tetiklenen G1-arrestin YT veya yca1? suşlarında oksidatif stres hassasiyeti üzerinde önemli bir etkisi olmadığıgözlenmiştir. Ayrıca, cycloheximide muamalesi ile protein agregat oluşumunun engellenmesininyca1? suşunda YT suşa benzer şekilde mitotik arrest sonucu oksidatif stres direnci oluşmasınayol açtığı görülmüştür. Sonuç: Mikrotübülleri hedef alan antikanser ilaçlarla tetiklenen mitotikarrest YT S.cerevisiae hücrelerinde oksidatif stres direncine yol açar. Sadece mitozda gelişen budirençte Yca1’in protein agregat oluşumunu engelleme fonksiyonu önemli rol oynamaktadır.
  • Küçük Resim Yok
    Yayın
    SLX5 deletion confers tolerance to oxidative stress in Saccharomyces cerevisiae
    (FEMS Microbiology Letters, 2022) Thomas, Pınar B.; Kaluç, Nur; Aybastıer, Önder
    Slx5, a subunit of a SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) in yeast, has been implicated in maintenance of genomic stability. SUMOylation is an important post-translational modification involved in the regulation of several important cellular processes and cellular response to various environmental stressors. Oxidative stress occurs when production of reactive oxygen species (ROS) exceeds the antioxidant defense capacity of the cell. Elevated ROS levels cause oxidative damage to important cellular macromolecules such as DNA, lipids, and proteins, which is associated with several diseases. Herein, we investigated the role of Slx5 in oxidative stress tolerance in Saccharomyces cerevisiae. We show that deletion of SLX5 increases survival of yeast cells in response to H2O2-induced oxidative stress in a cell cycle independent manner. Accumulation of intracellular ROS as well as DNA and lipid damages were reduced; expressions of antioxidant defense mechanism-related genes were increased in slx5 cells compared to wild type (WT) under oxidative stress. We also show that slx5 cells have increased intracellular ROS levels and oxidative damage to DNA and lipids compared to WT in the absence of oxidative stress. Thus, our data together suggest that an adaptive stress induced by SLX5 deletion increases tolerance to oxidative stress in slx5 cells.
  • Küçük Resim Yok
    Yayın
    Slx5/Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase deficiency shortens lifespan due to increased mutation accumulation in yeast
    (Oxford University Press, 2024) Thomas, Pınar Buket; Kaluç, Nur; Çavli, Irmak N.; Tuna, Bilge G.
    Chronological lifespan (CLS) in budding yeast Saccharomyces cerevisiae, which is defined as the time nondividing cells in saturation remain viable, has been utilized as a model to study post-mitotic aging in mammalian cells. CLS is closely related to entry into and maintenance of a quiescent state. Many rearrangements that direct the quiescent state enhance the ability of cells to endure several types of stress. SUMO-targeted ubiquitin ligases (STUbLs) play a critical role in mediating an adaptive response to various stresses. In this study, we investigated the effect of a STUbL, Slx5/Slx8, on CLS in budding yeast. We showed that both SLX5 and SLX8 deletions accelerate chronological aging, resulting in a decreased maximum and mean lifespan. slx5Δ cells were capable of entering or maintaining a quiescent state during aging. On the other hand, aging slx5Δ and slx8Δ cells had both increased spontaneous mutation accumulation. Our data together indicate that Slx5/Slx8 STUBL is required for normal rate of aging by preventing increased spontaneous mutation accumulation during aging.