Association analysis between malat1 rs3200401 single nucleotide polymorphism and bladder cancer development in Ukrainian population

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorChumachenko, Ya.
dc.contributor.authorVolkohon, A.
dc.date.accessioned2024-07-12T21:22:00Z
dc.date.available2024-07-12T21:22:00Z
dc.date.issued2019en_US
dc.departmentMaltepe Üniversitesi, Rektörlüken_US
dc.description.abstractIntroduction: Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 (MALAT1) is the long non-coding RNA (lncRNA) involved in transcriptional, post-transcriptional and epigenetic regulation of cell proliferation and differentiation. It was first established as metastasis prognostic factor for early stage non-small cell lung cancer, but modern studies indicate MALAT1 overexpression in various cancer types, particularly, in bladder cancer (BC). The aim of the research was to analyze the association between MALAT1 rs3200401 single nucleotide polymorphism (SNP) and BC development in Ukrainian population. Materials and Methods: Venous blood of 141 patients with diagnosed BC and 100 control subjects was used for genotyping. The rs3200401 SNP variants were detected by Real-time PCR using 7500 Fast Real-time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, USA) and Taq-Man Assays (TaqMan®SNP Assay C_3246069_10). Statistical calculations were realized in the Statistical Package for Social Science software (SPSS, version 17.0, Chicago, IL, USA) and P < 0.05 was considered as significant. Results: Using the binary logistic regression it was found that T-allele carriers had the lower risk of BC development compared to CC-genotypes (Pc = 0.008; ORc = 0.475, 95% CI = 0.274 – 0.825) according to the dominant model of inheritance. Moreover, CT-genotypes had lower probability of BC emergence in comparison with CC-genotypes (Pc = 0.024; ORc = 0.504, 95% CI = 0.278 – 0.914) in the additive model. After the adjustment for age, sex and smoking the statistically significant association was preserved in both dominant (Pa = 0.018; ORa = 0.504, 95% CI = 0.286 – 0.889) and additive (Pa = 0.045; ORa = 0.534, 95% CI = 0.289 – 0.987) models of inheritance. Discussion: It was found the significant protective effect of MALAT1 rs3200401 T-allele against BC development in Ukrainian population.en_US
dc.description.abstractGiriş: Metastazla ilişkili akciğer adenokarsinom transkripsiyon 1 (MALAT1), hücre çoğalmasının ve farklılaşmasının transkripsiyonel, transkripsiyonel ve epigenetik düzenlemesinde yer alan uzun kodlayıcı olmayan RNA’dır (lncRNA). İlk olarak küçük hücreli dışı akciğer kanseri için erken evrede metastaz prognostik faktör olarak kurulmuştur, ancak modern çalışmalar çeşitli kanser türlerinde, özellikle mesane kanserinde (BC) MALAT1 aşırı ekspresyonunu göstermektedir. Araştırmanın amacı, MALAT1 rs3200401 tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile Ukrayna popülasyonunda BC gelişimi arasındaki ilişkiyi analiz etmektir. Materyal ve Metodlar: Genotiplendirme için BC tanısı alan 141 hastanın ve 100 kontrol grubunun venöz kanı kullanıldı. Rs3200401 SNP varyantları, Real Time PCR Sistemi; 7500 Fast Real-time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, ABD) ve Taq-Man Assays (TaqMan®SNP Assay C_3246069_10) kullanılarak Real Time PCR ile tespit edildi. İstatistiksel hesaplamalar Sosyal Bilimler Yazılım İstatistik Paketi’nde (SPSS, sürüm 17.0, Chicago, IL, ABD) yapıldı ve P <0.05 anlamlı olarak kabul edildi. Sonuçlar: İkili lojistik regresyon kullanılarak, T-allel taşıyıcılarının, baskın kalıtım modeline göre CC-genotiplerine göre (Pc = 0.008; ORc= 0.475, % 95 CI= 0.274 - 0.825) karşılaştırıldığında BC gelişme riskinin daha düşük olduğu tespit edildi. Ayrıca, CT genotipleri, polimorfik modelinde CC genotiplerine kıyasla daha düşük BC ortaya çıkma olasılığına sahiptir (Pc = 0.024; ORc = 0.504, % 95 CI = 0.278 - 0.914). Yaş, cinsiyet ve sigara kullanımına göre gruplandırdıktan sonra, istatistiksel olarak anlamlı ilişki, hem baskın (Pa = 0.018; ORa = 0.504, % 95 CI = 0.286 - 0.889) hem de polimorfik modelinde (Pa = 0.045; ORa = 0.534, 95% CI = 0.289 - 0.987) korunmuştur. Tartışma: MALAT1 rs3200401 T-alelinin Ukrayna popülasyonunda BC gelişimine karşı önemli koruyucu etkisinin olduğu bulundu.en_US
dc.identifier.citationChumachenko, Ya. ve Volkohon, A. (2018). Association analysis between malat1 rs3200401 single nucleotide polymorphism and bladder cancer development in Ukrainian population / Ukrayna popülasyonunda malat1 rs3200401 tek nukleotid polimorfizmi ve mesane kanseri gelişimi arasındaki ilişki analizi. Maltepe Üniversitesi Uluslararası Öğrenci Kongresi. s. 33-34.en_US
dc.identifier.endpage34en_US
dc.identifier.isbn978-605-2124-26-0
dc.identifier.startpage33en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12415/5360
dc.language.isoenen_US
dc.publisherMaltepe Üniversitesien_US
dc.relation.ispartofMaltepe Üniversitesi Uluslararası Öğrenci Kongresien_US
dc.relation.publicationcategoryUluslararası Konferans Öğesien_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.snmzKY08394
dc.titleAssociation analysis between malat1 rs3200401 single nucleotide polymorphism and bladder cancer development in Ukrainian populationen_US
dc.title.alternativeUkrayna popülasyonunda malat1 rs3200401 tek nukleotid polimorfizmi ve mesane kanseri gelişimi arasındaki ilişki analizien_US
dc.typeConference Object
dspace.entity.typePublication

Dosyalar

Koleksiyon

Kongreler - Rektörlük